Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Olfr304-201ENSMUST00000077210 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TtrP07309 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Rnase13-201ENSMUST00000089771 1412 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Hist1h4f-201ENSMUST00000102971 391 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Hist1h4h-201ENSMUST00000102972 470 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm15347-201ENSMUST00000145372 385 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm28401-202ENSMUST00000190769 550 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm43310-201ENSMUST00000198975 820 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TtrP07309 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TtrP07309 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TtrP07309 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TtrP07309 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TtrP07309 Gm45088-201ENSMUST00000207066 1408 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TtrP07309 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TtrP07309 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TtrP07309 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms