Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 St7-206ENSMUST00000115417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms