Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm34358-201ENSMUST00000204585 665 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 AC139130.1-201ENSMUST00000228281 620 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Dtwd1-202ENSMUST00000170908 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm2649-201ENSMUST00000218825 610 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 CT033774.2-201ENSMUST00000222079 256 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm46995-201ENSMUST00000223445 1378 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 AC157772.1-201ENSMUST00000226266 365 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 AC132467.1-201ENSMUST00000226498 1845 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Olfr120-201ENSMUST00000077498 993 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Tbxas1-206ENSMUST00000162521 1427 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms