Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm43809-201ENSMUST00000200694 338 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn34c3J3QJW5 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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