Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms