Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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