Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col4a6B1AVK5 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms