Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm5114W4VSN8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm5114W4VSN8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms