Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm17190V9GX38 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm17190V9GX38 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm17190V9GX38 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gm17190V9GX38 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm17190V9GX38 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17190V9GX38 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm17190V9GX38 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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