Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt85Q9Z2T6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms