Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upk1bQ9Z2C6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk1bQ9Z2C6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms