Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms