Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn8Q9Z260 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms