Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Uso1Q9Z1Z0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Uso1Q9Z1Z0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms