Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms