Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VarsQ9Z1Q9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms