Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z199

Supt4h1b, Transcription elongation factor SPT4-B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt4h1bQ9Z199 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Supt4h1bQ9Z199 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Supt4h1bQ9Z199 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Supt4h1bQ9Z199 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Supt4h1bQ9Z199 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Supt4h1bQ9Z199 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Supt4h1bQ9Z199 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Supt4h1bQ9Z199 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Supt4h1bQ9Z199 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Supt4h1bQ9Z199 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Supt4h1bQ9Z199 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Supt4h1bQ9Z199 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Supt4h1bQ9Z199 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Supt4h1bQ9Z199 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms