Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms