Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R4

Itsn1, Intersectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn1Q9Z0R4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itsn1Q9Z0R4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Itsn1Q9Z0R4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itsn1Q9Z0R4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Itsn1Q9Z0R4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itsn1Q9Z0R4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Itsn1Q9Z0R4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itsn1Q9Z0R4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itsn1Q9Z0R4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itsn1Q9Z0R4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itsn1Q9Z0R4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itsn1Q9Z0R4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itsn1Q9Z0R4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itsn1Q9Z0R4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms