Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip2Q9Z0H8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms