Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slit3Q9WVB4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slit3Q9WVB4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms