Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx1Q9WV80 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx1Q9WV80 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx1Q9WV80 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx1Q9WV80 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx1Q9WV80 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx1Q9WV80 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx1Q9WV80 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx1Q9WV80 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx1Q9WV80 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx1Q9WV80 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx1Q9WV80 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx1Q9WV80 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms