Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms