Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms