Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp1Q9WTX5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms