Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkraQ9WTX2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkraQ9WTX2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms