Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TapbpQ9R233 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TapbpQ9R233 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TapbpQ9R233 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TapbpQ9R233 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TapbpQ9R233 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TapbpQ9R233 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TapbpQ9R233 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TapbpQ9R233 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TapbpQ9R233 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TapbpQ9R233 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms