Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim3Q9R1R2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms