Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chst4Q9R1I1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms