Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b2Q9R0K7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b2Q9R0K7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms