Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nek3Q9R0A5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms