Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms