Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d3cQ9QZS8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms