Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas3Q9QZQ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Npas3Q9QZQ0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms