Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnnt3Q9QZ47 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms