Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Map1aQ9QYR6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms