Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Rdh11Q9QYF1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Rdh11Q9QYF1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Rdh11Q9QYF1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Rdh11Q9QYF1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Rdh11Q9QYF1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Rdh11Q9QYF1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh11Q9QYF1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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