Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms