Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms