Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms