Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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