Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms