Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc5Q9QX29 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms