Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyth1Q9QX11 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyth1Q9QX11 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms