Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms