Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trappc2lQ9JME7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trappc2lQ9JME7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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