Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Rabgef1Q9JM13 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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