Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf19Q9JLL3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms