Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL0

Crim1, Cysteine-rich motor neuron 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crim1Q9JLL0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crim1Q9JLL0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Crim1Q9JLL0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms