Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms